职务

生命科学学院副院长

邮箱ypzhao@zju.edu.cn

地址生命科学学院429室

赵云鹏，浙江大学生命科学学院/生态研究所教授，博士生导师，主要从事中国特有活化石树种（银杏、珙桐等）的进化生态学与保护生物学研究。利用BT/IT融合技术和生态基因组大数据，构建银杏基因库等平台，研究生活史性状进化与种群动态的关系，聚焦次生代谢物多样性、物候等的性别二态性与适应性进化，精准指导孑遗濒危和药食同源植物的遗传资源数字序列信息（DSI）保护和利用。同时，建立大学校园生物多样性观测网络，大力推动以大学生社团为主体的生物多样性公众科学。

先后主持国家自然科学基金、科技部基础工作专项课题、国家重点研发计划子课题等项目20余项，主参国家基金重点项目、国际合作项目等。在Nature Communications、Journal of Ecology、eLife等期刊发表论文60余篇，主编或参编专著5本，获得国家发明专利5项、省部级成果奖5项。现任中国植物学会理事、浙江省植物学会副理事长、NSII中国大学植物网联盟负责人、中国植物学会药用植物及植物药专业委员会委员、Plant Diveristy等期刊编委。

学习经历：

1996–2000：南京农业大学园艺系观赏园艺专业，学士

2000–2003：南京农业大学园艺学院园林植物与观赏园艺专业，硕士

2003–2006：浙江大学生命科学学院植物学专业，博士

国内工作经历：

2006–迄今：浙江大学生命科学学院，师资博士后、讲师、副教授、教授

2013–迄今：浙江大学求是青年学者，博士生导师

海外工作经历：

2009.08–2009.10，2010.07–2010.10：美国北卡州立大学植物学与微生物学系，访问学者

2011.12–2013.10：德国海德堡大学生物研究中心，访问学者

校内任职/兼职：

浙江大学生命科学学院 副院长（2021–迄今）

浙江大学信息技术中心 副主任（2020–2021）

浙江大学生命科学公共基础课程教学研究中心 主任（2022–迄今），常务副主任（2019–2022）

学术兼职：

中国植物学会 理事（2023–迄今），药用植物与植物药专业委员会 委员（2014–迄今）

浙江省植物学会 副理事长（2022–迄今）

中国林学会银杏分会 理事（2017–迄今），自然教育委员会 委员（2019–迄今）

Plant Diversity 编委 (2022–迄今)

Medicinal Plant Biology 编委 (2023–迄今)

Plant Systematics and Evolution 编委 (2014–迄今)

IUCNSpecies Survival Commission (SSC)裸子植物专家(2021–迄今)

《高校生物学教学研究（电子版）》 常务编委 (2022–迄今)

社会服务：

浙江省农业农村厅 浙江省中药材产业技术创新与推广服务团队专家（2019–迄今）

浙江省禁毒委员会办公室和浙江省农业农村厅 毒品原植物检验咨询专家（2018–迄今）

阿里巴巴公益基金会 自然教育专家顾问（2018–迄今）

大型纪录片《影响世界的中国植物》 创作顾问（2017–2019）

工作研究项目

孑遗濒危植物进化生态学：

11. 银杏次生代谢物性二态性时空格局的遗传基础和适应性进化，国家自然科学基金面上项目，2024.1–2027.12，主持

10. 濒危野生动植物智慧保护技术研究及应用示范，浙江省领雁计划项目，2023.1–2025.12，主持

9. 基于多组学方法的银杏次生代谢物多样性的遗传基础与进化成因研究，浙江省自然科学基金重点项目，2021.1~2023.12，主持

8. 银杏性染色体进化阶段的确定及进化驱动力研究，国家自然科学基金面上项目，2021.1–2024.12，主持

7. 银杏不同避难所种群动态历史对第四纪气候振荡的特异性响应机制研究，国家自然科学基金面上项目，2019.1–2022.12，主持

6. 珍稀濒危木本植物银杏、珙桐、天竺桂对全球变化的响应及其保护对策，国家重点研发计划（全球变化对北半球木本植物多样性的影响）子课题，2017.7–2022.6，主持

5. 银杏种群遗传多样性形成与优质遗传资源鉴定研究，浙江省公益性技术应用研究专项，2014.1–2016.12，主持

4. 银杏天目山“避难所”群体的景观遗传学研究，浙江大学青年科研创新专项，2012.3–2013.12，主持

3. 银杏小尺度遗传结构与基因流：基于天目山“避难所”群体的SSR研究，国家自然科学基金青年项目，2011.1 – 2013.12，主持

2. 东亚北美间断分布森林群落生物多样性形成的地史制约、局域适应和种间互作研究，国家自然科学基金中美合作项目，2015.1–2019.12，PI

1. 世界菝葜科植物的系统发育与生物地理学研究，国家自然科学基金重点项目，2009.1–2012.12，排名2/10

道地药材次生代谢多样性：

8. 玄参新品种选育，浙江省农业新品种选育重大科技专项子课题，2021.1~2025.12，主持

7. 玄参新品种选育研究，浙江省农业（中药材）新品种选育重大专项子课题，2016.1-2020.12，主持

6. 玄参环烯醚萜苷的时空格局与遗传变异研究，浙江省自然科学基金，2013.1–2015.12，主持

5. “浙八味”药材道地性及质量评价技术体系研究，浙江省中药材农业新品种选育重大科技专项子课题，2012.1–2015.12，排名2/7

4. 玄参属东亚类群多倍化物种形成及浙玄参栽培起源研究，国家自然科学基金面上项目，2011.1–2013.12，排名3/6

3. 药用植物资源药用品质评价模式的研究，浙江省自然科学基金，2009.1–2010.12，主持

2. 中药材生产质量管理规范完善及野生中药材采收加工规范，国家科技支撑计划子课题， 2008.1–2010.12，主持

1. 重要药源植物品种选育和规范化栽培技术研究（猫人参、八角莲），浙江省中药现代化专项，2007.1–2009.12，排名：2/10

生物多样性调查、编目、建库、解说：

10. 诸暨市东白山省级自然保护区综合科考，2021–2022，植物子课题主持

9. 天目山生态环境保护与提升工程—解说系统设计与实施项目，2021–2022，主持

8. 钱江源国家公园环境教育解说系统开发，2018.7–2019.6，主持

7. 中国大学校园植物网的构建与示范，国家标本资源共享平台专项，2017.6–2021.12，主持

6. 教学标本子平台运行服务项目（浙江大学教学标本数据更新），科技部国际基础条件平台项目，2014.1–2020.12，主持

5. 泛喜马拉雅植物志第8卷Liliales部分科属的编研及修订，国家重点实验室开放基金，2011.6–2013.5，主持

4. 浙江省野生植物资源调查、建档、编纂（百合科、菝葜科、百部科），浙江省林业厅科技项目（新版《浙江植物志》编著）子课题， 2014.11–2016.12，主持

3. 浙江天目山、龙王山和清凉峰种子植物多样性调查，科技部基础工作专项（华东黄山-天目山脉和仙霞岭-武夷山脉生物多样性调查）第二课题， 2015.1–2019.12，主持

2. 中国西南地区极小种群野生植物调查种质保存（银杉、毛枝五针松、水松、云南穗花杉、鹅掌楸），科技部基础工作专项子课题，2017.1–2021.12，主持

1. 我国水生、耐盐中药资源的合理利用研究项目（浙江诸暨、余姚），中医药行业科研专项（第四次全国中药资源再查试点项目），2014.6–2016.12，主持

【发表论文】

71. Wu JJ, Deng QW, Qiu YY, Liu C, Lin CF, Ru YL, Lai J, Shen XX, Pan RH*,Zhao YP*. 2024. HGT is unevenly distributed in land plants and contributes to the diversification of guanine metabolism.New Phytologist10.1111/nph.20040

70. Lin HY, Li WH,Zhao YP*. 2024. A diverging species within theStewartia gemmatacomplex revealed by RAD-seq data.Plants13(10): 1296.

69. Chen MY, Lin CF, Sun YQ, Yang R, Lu XY, Lou WD, Deng XF,Zhao YP*, Liu F*. 2024.Ginkgo bilobasex identification methods using hyperspectral imaging and machine learning.Plants13(11): 1501.

68. Li DQ#, Lin HY#, Wang XY, Bi B, Gao Y, Shao LM, Zhang RL, Liang YW, Xia YP,Zhao YP, Zhou XF, Zhang LS*. 2023. Genome and whole-genome resequencing of Cinnamomum camphora decipher its dominance in subtropical urban landscapes.BMC Biology21: 192.

67. Wu, ZF, Fu YS, Crowther T, Wang SX, Gong YF, Zhang J,Zhao YP, Janssens I, Peñuelas J, Zohner C. 2023. Poleward shifts in the maximum of spring phenological responsiveness of Ginkgo biloba to temperature in China.New Phytologist240: 1421–1432.

66. Wu JJ, Han YW, Lin CF, Cai J*,Zhao YP*. 2023. Benchmarking gene set of gymnosperms for assessing genome and annotation completeness in BUSCO.Horticulture Research10: uhad165.

65. Qi ZC, Li P, Wu JJ, Gamisch A, Yang T,Zhao YP, Xu WQ, Chen SC, Cameron Ken, Qiu YX, Fu CX. 2023. Climatic niche evolution in Smilacaceae (Liliales) drives patterns of species diversification and richness between the Old and New World.Journal of Systematics and Evolution DOI: 10.1111/jse.12998

64. Liu YC, Zhang RY, Lin CF, Zhang ZC, Zhang R, Shang KK, Zhao MS, Huang JY, Wang XN, Li Y, Zeng YL,Zhao YP, Zhang J, Xing DL. 2023. Remote sensing of subtropical tree diversity: The underappreciated roles of the practical definition of forest canopy and phenological variation.Forest Ecosystems10: 100122.

63. Lin HY; Yang Y, Li WH, Luo YX, Bai XH, Ohi-Toma T, Kim C, Kim JH*,Zhao YP*. 2023. Species boundaries and conservation implications ofCinnamomum japonicum, an endangered plant in China.Journal of Systematics and EvolutionDOI: 10.1111/jse.12950

62. Yang T, Tedersoo T, Soltis PS, Soltis DE, M Sun, Ma YY, Ni YY, Liu X, Fu X, Shi Y, Lin HY,Zhao YP, Fu CX, Dai CC, Gilbert JA, Chu HY. 2022. Plant and fungal species interactions differ between aboveground and belowground habitats in mountain forests of eastern China.Science China Life Sciences65, https://doi.org/10.1007/s11427-022-2174-3

61.Wu D, Yang T, Lin CF, Fu X,Zhao YP, Chu HY. 2022. Elevational distribution of soil diazotrophic community in root zone ofGinkgo bilobain Tianmu Mountain.Soil54(5): 958–967. (in Chinese)

61.吴狄，杨腾，林臣峰，付晓，赵云鹏，褚海燕. 2022.天目山银杏根区土壤固氮微生物群落沿海拔梯度的分布特征.土壤54(5): 958–967.

60. Huang KY, Kan SL, Shen TT, Gong P, Feng YY, Du H,Zhao YP, Wan T, Wang XQ, Ran JH. 2022. A comprehensive evolutionary study of chloroplast RNA editing in gymnosperms: A novel type of G-to-A RNA editing is common in gymnosperms.International Journal of Molecular Sciences23: 10844.

59. Lin HY, Sun M, Hao YJ, Li DJ, Gitzendanner MA, Fu CX, Soltis DE, Soltis PS,Zhao YP*. 2023. Phylogenetic diversity of eastern Asia–eastern North America disjunct plants is mainly associated with divergence time.Plant Diversity45: 27–35.

58. Sun Y, Bai PP, Gu KJ, Yang SZ, Lin HY, Shi CG*,Zhao YP*. 2022. Dynamic transcriptome and network-based analysis of yellow leaf mutantGinkgo biloba.BMC Plant Biology22: 465.

57. Bai PP, Lin HY, Sun Y, Wu JJ, Gu KJ,Zhao YP*. 2022. Temporal dynamic transcriptome landscape reveals regulatory network during the early differentiation of female strobilus buds inGinkgo biloba.Frontiers in Plant Science13: 863330.

56. Gu KJ, Lin CF, Wu JJ,Zhao YP*. 2022. GinkgoDB: An ecological genome database for the living fossil,Ginkgo biloba.Database2022: baac046.

55. Lin HY, Li WH, LinCF, Wu HR,Zhao YP*. 2022. International Biological Flora:Ginkgo biloba.Journal of Ecology110(4): 951-982.

【封面文章，Cover Story】

54. Wu Z, Wang S, Fu Y*, Gong Y, Lin CF,Zhao YP*, Boeck HJ, Zohner C. 2022. Spatial difference of interactive effect between temperature and daylength on ginkgo budburst.Frontiers in Plant Science13:887226.

53. Wu ZF, Lin CF, Wang SX, Gong YF,Zhao YP*, Tang J, Boeck HJ, Vitasse Y, Fu YS*. 2022.The sensitivity of ginkgo leaf unfolding to the temperature and photoperiod decreases with increasing elevation.Agricultural and Forest Meteorology315: 108840.

52. Ni YY, Yang T, Ma YY, Zhang KP, Soltis PS, Soltis DE, Gilbert JA,Zhao YP, Fu CX, Chu HY. 2021. Soil pH determines bacterial distribution and assembly processes in natural mountain forests of eastern China.Global Ecology and Biogeography30(11): 2164-2177.

51. Liu JJ,Zhao YP, Si XF, Feng G, Slik F, Zhang J. 2021. University campuses as valuable resources for urban biodiversity research and conservation.Urban Forestry & Urban Greening64: 12755.

50. Lin HY, Gu KJ, Li WH,Zhao YP*. 2022. Integrating coalescent-based species delimitation with ecological niche modeling delimited two species within theStewartia sinensiscomplex (Theaceae).Journal of Systematics and Evolution60(5): 1037-1048.

【JSE 2020~2022年物种划分研究的2篇典型案例之一】

49. Melton A, Chen SC,Zhao YP, Fu CX, Xiang QY, Cheng SF, Wong GKS, Soltis PS, Soltis DE, Gitzendanner MA. 2020. Genetic insights into the evolution of genera exhibiting the eastern Asia – eastern North America floristic disjunction: A transcriptomics analysis.American Journal of Botany107(12): 1736-1748.

48. Hui C, Zhang YP, Ni X, Cheng QL,Zhao YP, Zhao YH, Du LN, Jiang H. 2020. Interactions of iron-based nanoparticles with soil dissolved organic matter: Adsorption, aging, and effects on hexavalent chromium removal.Journal of Hazardous Materials406: 124650.

47. Zhang LS, Wu SD, Chang XJ, Wang XY,Zhao YP, Xia YP, Trigiano RN, Jiao YN, Chen F. 2020. The ancient wave of polyploidization events in flowering plants and their facilitated adaptation to environmental stress.Plant, Cell and Environment43(12): 2847-2856.

46. Fan G, Liu X, Sun S, Shi C, Du X, Han K, Yang B, Fu Y, Liu M, Seim I, Zhang H, Xu Q, Wang J, Su X, Shao L, Zhu Y, Shao Y,Zhao YP, Wong AKC, Zhuang D, Chen W, Zhang G, Yang H, Xu X, Tsui SKW, Liu X, Lee SMY. 2020. The chromosome level genome and genome-wide association study for the agronomic traits ofPanax Notoginseng.iScience23 (9): 101538.

45. Chen C, Zheng Z, Bao Y, Zhang H, Richards CL, Li J, Chen Y,Zhao YP,Shen ZG, Fu CX. 2020. Comparisons of natural and cultivated populations ofCorydalis yanhusuoindicate divergent patterns of genetic and epigenetic variation.Frontiers in Plant Science11: 985.

44. Kattge J, Bönisch G, Díaz S, …,Zhao YP, …Wirth C. 2020. TRY plant trait database – enhanced coverage and open access.Global Change Biology26(1):119-188.

43.Zhao YP#, Fan G#, Yin P-P#, Sun S#, Li N#, Hong X#, Zhang H, Hu G, Zhang F-M, Han J-D, Hao Y-J, Xu Q, Yang X, Xia W, Chen W, Lin H-Y, Zhang R, Chen J, Zheng X-M, Lee S. M-Y, Lee J, Uehara K, Wang J, Yang H, Fu C-X*, Liu X*, Xu X*, Ge S* 2019. Resequencing 545 ginkgo genomes across the world reveals evolutionary history of the living fossil.Nature Communications10: 4201.

【Research Highlight:Ginkgo history told by genomes. Nature Plants 5: 1029 (2019)】

42. Dong YB, Chen SC, Cheng SF, Zhou WB, Ma Q, Chen ZD, Fu CX, Liu X*,Zhao YP*, Soltis PS*, Wong GK*, Soltis DE*, Xiang J*. 2019. Natural selection and repeated patterns of molecular evolution following allopatric divergence.eLife8: e45199.

【Insight article:Speciation: How predictable is genome evolution?】

【专利】

1. 一种用于鉴别银杏性别的分子标记、引物对和方法，发明人：赵云鹏、顾凯杰、孙悦、范广益、张睿，专利号：ZL 201911204191.2，申请日期：2019年11月29日，授权日期：2022年1月4日，专利权人：浙江大学

2. 鉴定浙江种源的玄参的核苷酸序列、核酸分子探针和方法，发明人：陈川、赵云鹏、陈炳龙、潘兰兰、傅承新，专利号：ZL 200710070814.2，申请日期：2007年7月3日，授权日期：2011年7月27日，专利权人：浙江大学

3. 鉴别浙贝母变种——东贝母的核苷酸序列，分子探针和技术方法，发明人：赵云鹏，刘晓贤、陈川、潘兰兰、陈斌龙、傅承新，专利号：ZL 200710069883.1，申请日期：2007年8月17日，授权日期：2010年5月26日，专利权人：浙江大学

4. 一种鉴定全叶延胡索的方法，发明人：陈川、赵云鹏、宗敏、陈炳龙、傅承新，专利号：ZL 200810163138.8，申请日期：2008年12月18日，授权日期：2012年1月11日，专利权人：浙江大学

5. 三叶青的组培快速繁殖方法，发明人：姜维梅、赵云鹏、傅承新，专利号：ZL 200710070701.2，申请日期：2007年8月6日，授权日期：2010年8月4日，专利权人：浙江大学

【标准】

1. “道地药材 第10部分：浙玄参”团体标准. T/CACM 1020.10—2019. 起草人：宗侃侃、李娟、李明焱、何伯伟、吴华庆、王志安、姚德中、赵云鹏、黄璐琦、郭兰萍等。中华中医药学会2019.08.13发布实施

【获奖】

1. 基于科教融合理念的国际化植物学野外实践教学模式的构建和实践，浙江大学教学成果一等奖，排名：3/8（2021）

2. 中国及其邻近地区暖温带森林特有植物类群的谱系地理与物种形成，教育部高校自然科学奖二等奖，排名：3/7（2016）

3. 生物学野外实习基地共享探索与实践，浙江省第七届高等教育教学成果奖一等奖，排名：10/10（2014）

4. 天目山植物多样性与珍稀濒危物种保育关键技术研究，浙江省科学技术奖二等奖，排名：8/15（2013）

5. 研究型大学基础课《植物学》国际化、研究化教学的改革与实践，浙江大学教学成果奖一等奖，排名：2/7（2012）

6. 濒危药用植物八角莲的保护遗传学及可持续利用，浙江省科学技术奖二等奖（2008C12004），排名：4/7（2008）

【奖励荣誉】

1. 浙江大学优秀班主任（2008）

2. 浙江大学生命科学学院奖教金（2009）

3. 浙江大学生命科学学院先进工作者（2009）

4. 浙江大学生命科学学院先进工作者（2014）

5. 浙江大学优质教学奖二等奖（2015）

6. 浙江大学生命科学学院优秀共产党员（2016）

7. 浙江大学暑期大学生社会实践活动十佳指导教师（2016）

8. 浙江省第十届高等学校青年教师教学竞赛理科组二等奖（2017）

9. 浙江大学青年教师教学竞赛一等奖（2017）

10. 浙江大学优秀研究生德育导师（2018）

11. 浙江大学生命科学学院“勤学励志”育人奖教金（2018）

12. 浙江大学生命科学学院先进工作者（2019）